22世纪末,被人类称作“加米拉斯”的不明外星生物盘踞火星,并持续向地球发射带有这只怪鸟的下场,让门口的另外三只怪乌都又悲又惊,其中一只大概是地上这只将死的怪鸟伴侣,只见它悲鸣着用脑袋去碰血泊里的那只怪鸟,血泊里的怪鸟也用虚弱的眼睛望着这只悲鸣的怪鸟。强烈放射姓物质的游星炸弹,致使地球人死伤无数,濒临灭绝,被迫转到地下求生。在这紧要关头,人类组成宇宙舰队远征火星,结果几乎全军覆没,侥幸逃回的大和号成为人类最后的希望。与此同时,一个神秘装置穿越万里银河坠落地球,经检测发现该装置竟然能消除放射姓物质。为了从装置的主人——麦哲伦星云伊斯坎达尔星的高智慧生物那里寻求帮助,人类决定孤注一掷,派遣大和号进行这次远征。火星之战中失去哥哥的原宇宙舰队成员古代进(木村拓哉饰)应召归队,和一众好友成为了见证伟大历史时刻的一员。而得知人类动向的加米拉斯也发起了一波波的致命攻击…… 本片根据松本零士的同名原著改编。